摘要：为研究厚壳贻贝（Mytilus coruscus）生长海域微生物群落的结构与多样性特征，初步探究海域微生物群落及共生菌对贻贝生长的影响，分别采集舟山市东极镇庙子湖岛和嵊泗县枸杞岛厚壳贻贝养殖区和野生生长区海水样品，利用16S rRNA扩增子测序技术，比较分析不同海域微生物群落的组成及丰度特征以及微生物群落的差异；同时对厚壳贻贝体内的微生物进行了初步的分离鉴定。研究结果显示，嵊泗厚壳贻贝野生生长海域10 m水深的微生物丰富度显著大于5 m水深，东极厚壳贻贝养殖区海域10 m水深微生物丰富度也而明显大于5 m水深。东极和嵊泗厚壳贻贝的生长海域形成了较为稳定微生物群落结构，嵊泗海域主要优势菌群为十八杆菌属Octadecabacter、假交替单胞菌属Pseudoalteromonas、厌氧氨氧化菌属Candidatus_Portiera、沉积物陆丹氏菌属Loktanella和弧菌Vibrio；东极海域主要优势菌群为厌氧氨氧化菌属Candidatus_Portiera、海洋氨氧化古菌属Nitrosopumilus、蓝细菌聚球藻属Synechococcus和弧菌属Vibrio。PCA分析结果表明东极和嵊泗两个海域的厚壳贻贝野生生长区的微生物群落相似度明显低于养殖区的微生物群落相似度，且这种差异在嵊泗海域尤为明显。同时在贻贝体内分离出了假交替单胞菌、黏着杆菌以及弧菌，而这三种菌在海水样品中也大量存在，由此可初步判定这三类细菌能够随水流进入贻贝体内，并可能对贻贝的附着、生长以及防病等生理功能产生一定的影响。