由于水库养殖螃蟹的水域面积大，养殖池水深而且很难将水库中水排净，因此就很难采用传统螃蟹养殖的地笼捕捞法。

一、蟹簖捕捞法

蟹簖捕捞法；这种方法利用大闸蟹晚上出来活动时的趋光性原理，在水库的浅滩中放置蟹簖，将蟹簖用竹竿插入水底，保持上部露出水面；等太阳落山天黑后，用灯光照射。大闸蟹看到光亮会朝灯光处爬行聚集，而蟹簖拦住螃蟹爬行的路，螃蟹就会顺着蟹簖往上爬，此时守在蟹簖旁边的人就能用手或网抄轻易的将螃蟹捕捞起。这种捕捞方法效率不高，而且需要花费大量人工。

二、丝网捕捞法

丝网捕捞法（最常用的方法）；在水库中放入长长的丝网，丝网在网端浮子在作用下会悬挂于水中间。当螃蟹游动时就会触碰到网上，由于丝网很细密，一旦螃蟹触碰到就会被网紧紧缠绕，并无法脱身。等待一段时间后将丝网收起，取下缠绕在网上的螃蟹即可。这种捕捞方法简单、效率高、成本低，还可以用机械操作，大大节省了人力。

三、拖网捕捞法

拖网捕捞法；在水库湖岸一端固定一根桩基，将带有铅块的拖网用船慢慢放入到湖底。随着船的开动，拖网会围拢成半圆形，慢慢在湖底运动，这时围网所到之处湖底的螃蟹都会被拖网捕捞到。这种方法捕捞区域大，适合养殖湖底平坦的水域。

四、人工捕捞法

人工捕捞法；大闸蟹在每年10月中下旬性腺发育成熟后会洄游交配繁育。因此利用这一生物特性，在这个季节可在湖岸或者进出水口处进行人工捡捞。

水库养殖大闸蟹可以很好的进行资源利用，但是水库养殖大闸蟹也有一定的弊端的，特别是在捕捞螃蟹时，由于养殖水域面积大，不论采用什么样的捕捞方法，都不能将所有大闸蟹都捕捞完，这样就会造成捕捞不全带来的一部分经济损失及产量无法估算。螃蟹的存塘，对于下一年苗种投放量也会存在一定影响。