影响食用菌因素有：营养物质、酸碱度、温度、水分、氧和二氧化碳、光照以及生物因素。
A、 营养物质
营养物质的利用是通过菌丝分泌木质素酶，
一般地说，真菌在菌丝迅速生长期间，其基质的C/N比高，往往有利于脂肪的合成，在孢子萌发的前期C/N比高，后期低，总得来说：在子实体分化发育阶段，C/N过高则不能形成菌蕾；C/N过低，则又使众多的原基夭折。菌丝生长阶段的C/N约为20:1；子实体分化阶段，C/N约为18:1。
B、 酸碱度
大多数真菌是喜酸性基质的，一般能适应的pH范围为3-8，香菇为4.0-5.4，木耳为5.0-5.4，双孢蘑菇为6.8-7.0，金针菇为5.4-6.0，猴头菇为4.0，草菇为7.5。加入适量磷酸氢二钾等缓冲物质，使培养基的pH得到稳定，在产酸过多时，可添加适量的碳酸钙等
C、 温度
喜低温或低温结实的有金针菇和滑菇；喜高温的有草菇，
关于温度与食用菌生长发育关系点：
a 食用菌的菌丝体较耐低温。b、 菌落在琼脂平板上的最快生长速度的温度，不一定就是生理上最佳温度。C就香菇而言，昼夜温差幅度增大，可以刺激成熟的菌丝体形成原基。
D、 水分和湿度
香菇和金针菇的代料栽培中，培养料的含水量为干料的1.8-2.6 倍，菌丝生长最佳。但在子实体分化发育期，则以水分为干料重量的2.6-3.4 倍为最适宜。
适宜于食用菌生长的培养料含水量约为湿料总重量的60%。相对湿度一般控制在80-90%之间。
E、 氧和二氧化碳
食用菌都是好气性的，对蘑菇及草菇，当CO2浓度超过0.1%时，就对子实体产生毒害作用。当CO2浓度在1000ppm以下时，平菇子实体尚可正常形成，但当其浓度超过1300ppm时，子实体出现畸形。
F、 光照
光照对于食用菌子实体分化和发育关系重大，对菌丝生长几乎没有关系。只有双孢蘑菇和大肥菇可以在完全黑暗的条件下正常生长
二、 食用菌的生态
绝大多数的食用菌都是腐生性的。
微生物的群社关系很复杂， 1中性关系 2竞争关系3寄生关系4偏利共栖关系5.共生关系
菌种制备
食用菌的菌种系指经人工培养并进行扩大繁殖和用于生产的菌丝体。菌种的优劣主要取决于菌株原有的种性及制种技术水平的高低。
一、 工艺流程
培养料的贮备和预处理------- 容器、工具的洗涤------ 配料、培养基制作------ 灭菌------ 冷却------ 接种------ 培养------- 贮存
二、 纯种分离
菌种的分离方法主要有：孢子分离法、组织分离法、基内菌丝分离法和土中菌丝分离法。
1． 孢子分离法：属有性繁殖。对于香菇、平菇异宗结合的菇类，为避免产生单孢不孕现象，必须采用多孢分离法。单孢分离法主要用于杂交育种的研究。
（1）种菇的选择和处理
种菇选择的标准：必须纯正，具有本菌株性状，发育健壮，无病虫害，成熟度适当。种菇选定后，首先除去附着在菇体表面的杂物，如蘑菇、草菇可用0.1%升汞浸泡消毒2-3分钟，然后用无菌水漂洗3次，以洗除表面附着的药物，最后用无菌纱布吸干水分。香菇、平菇可用75%酒精进行表面消毒。
（2）．多孢分离法
① 整菇播种法② 钩悬法③ 贴附法 4菌褶上抹取孢子法⑤ 孢子印分离法 ⑥ 空中孢子捕捉法
（3）．单孢子分离法
一般采用方法：平板稀释法、连续稀释法、毛细管法等。
2． 组织分离法
（1）子实体分离法（2）菌核分离法（3）菌索分离法：对一些不易找到子实体及菌核的菌类
3．基内菌丝分离法
对于子实体只有在特定的季节下出现，平时不易采到，或子实体小而薄或呈胶质状态
（1）菇木（或耳木）分离法：在食用菌繁殖旺盛期从菇木中分离菌丝体。
（2）代料基质分离法：分离前，选择一批子实体发生早、产量高、菇体尚幼嫩且生活力强而无病虫害的栽培袋，待子实体将近成熟时，去掉子实体，然后用75%酒精将培养袋进行消毒后，在培养料下1.5cm处挑取0.3cm的培养料小方块组织，接入试管培养基的中央，置于恒温下培养。
（3）土中菌丝分离法：用于采集生长在土中的菇类菌丝体
三、保藏及复壮
1． 菌种保藏方法
菌种保藏的基本手段是采用低温、冷冻、干燥、减少供氧量等方法，终止其繁殖，降低其代谢强度，使之处于休眠状态。
（1）． 斜面低温保藏法：保藏时间不长。
（2） 液体石蜡保藏法：保藏期限可达3-5年。
（3）．滤纸保藏法：保藏期限可达2-5年。
（4）真空冷冻干燥保藏法：保存时间可达数年（5）液态氮超低温保藏法：国际流行的新技术。
2． 菌种复壮技术
提纯复壮。主要有组织分离法及菌丝体复壮的方法。
四、菌种繁育
菌种的生产仍是采用三级制种方法.即母种，原种，生产种.要想生产出合格的菌种，必须先培育出母种，而后由母种制成原种，由原种制成生产种.而后用生产种转接成栽培袋，再进行出菇管理.
1,母种：又叫一级种，用直径18-22cm的试管制备。常用配方：去皮马铃薯200克，葡萄糖20克，琼脂10-20克，水1000毫升，先把土豆去皮称重，切成小块煮至熟而不烂，过滤加水至1000毫升，再把琼脂剪成小段，放入锅内，边搅边煮，待琼脂溶化后加入葡萄糖，由于琼脂质量各有不同加入份量要看情况而定，装管前取一小勺浮在凉水中冷却观察其硬度适合然后分袋试管，用棉花塞塞住试管口，放入小高压锅内灭菌，当压力表达到1.5个压力时，再灭菌30分钟，取出试管放成斜面，放置2-3 天后，无杂菌感染再放入接种箱内接种，接了种的试管放入培养室内进行培养，温度要求25℃左右，相对湿度75%以下。
2,原种：二级种，一般采用原种瓶和罐头瓶.培养料不要装的太满，装至瓶肩.原种的制备多采用谷粒种，锯沫种和棉子壳种。
①谷料种：用玉米、小麦为原料，精选后煮沸，使种子变软即成，不要煮的太熟，开花.熟后离火泡5分钟（不开盖而能吸足水份）而后装瓶，用小型或中型高压锅灭菌，放至温度25℃左右接入母种，放培养室内培养.一般25-30天即成。
②木屑种：木屑78%、麦麸20%、石膏1%、糖1%、料：水=1:1.3，拌匀装瓶，灭菌，接种培养。一般25-30天即成。
③棉子皮：因棉子皮各种营养丰富，一般不需要加其它物质，只加1%的糖和石膏，用料1.3-1.5倍的水拌匀即可，而后装瓶，灭菌，接种，培养即可。
推荐通用配方：木屑（或秸秆粉或棉籽壳）80斤，糠麸6斤，糖0.5斤，菇耳壮1.6两，石膏1斤
3,生产种：可用木屑，玉米，棉籽皮，菌草，麦秸等为原料，根据所栽培的品种，采用不同的配方，用聚乙烯或聚丙烯，直径15-28cm塑料袋装料，然后用常压灭菌锅灭菌，达到100℃后，再维持100℃8-10小时.待袋稍凉后出锅，使栽培袋温度降至25℃左右再用原种接种，而后放到培养室的培养架上培养。
栽培管理
食用菌栽培的方式多种多样。按培养料分，有段木栽培和代料栽培；按栽培方式分，有畦栽、床栽和箱栽；按培养场所分，有室内栽培、室外栽培等。段木栽培越来越少，原因是因为破坏林木资源。食用菌的代料栽培包括生料栽培、熟料栽培和发酵料栽培。生料栽培是指按照配方将培养料加水拌匀后直接用于食用菌栽培的方法；熟料栽培是指按照配方将培养料加水拌匀、装袋、灭菌后再接种栽培食用菌的方法；发酵料栽培是指将培养料加水拌匀后经发酵以杀灭有害杂菌和虫卵，并使培养料腐熟，然后用于食用菌栽培的方法。用于生料栽培的棉籽壳等材料必须新鲜，不结块、不霉变，气温在15℃以下。用于熟料和发酵料栽培的材料不必新鲜，高温、低温季节均可。平菇可用生料栽培；双孢蘑菇、鸡腿菇、巴西蘑菇、金顶侧耳等可用发酵料栽培；灵芝、香菇、金针菇等用熟料栽培。双孢蘑菇、巴西蘑菇等多用床栽，其他食用菌多用袋栽。主要代料栽培方法要点介绍如下：
（一）双孢蘑菇的栽培
双孢菇床架栽培
1.常用栽培原料
1．农作物秸杆；
2．粪肥；
3．辅料
4．化肥。
配方举例：牛粪58%、麦草40%、石膏1%、过磷酸钙1%。
2．培养料的堆积发酵
1．目的：杀死有害杂菌和虫卵；料腐熟有利于菌丝利用。
2．时间：前发酵12天，后发酵6天，时间随气温而定。
（3）方法：前发酵，2-3天翻堆一次；后发酵，控温发酵。
2．接种
1．穴播法；
2．混播法；
3．层播法。
3．覆土
1．目的：促进原基形成；保持料面湿润；支撑子实体生长。
2．时间：菌丝长至培养料2/3，时间随菌丝生长情况而定。
3．方法：粗土粒1-2厘米；细土粒0.5-1厘米。先覆粗土，以不露床面为宜；再覆细土，盖在粗土粒上面；土层共厚4~5厘米。
5．出菇管理
覆土后7d，当菌丝爬上土层后，喷一次出菇水，喷水量为1kg/m2左右，以后应根据培养料和土层的干湿、出菇的密度和子实体的不同生长发育期灵活喷水。空气湿度保持在85%-95%，并注意通风换气和利用散射光诱导原基的形成。一般在覆土后15d左右出现菇蕾，20d左右开始采收头潮菇。
6．头潮菇后管理要点
在最适栽培条件下，巴西蘑菇的菇潮间期一般为10~12d。调节好温度、水分、通风、保湿、光线等环境因子，适时诱导子实体形成，对缩短栽培周期，减少呼吸消耗，提高产量意义重大。在头潮菇后，床面喷水应以轻喷与重喷相结合的原则，坚持每潮菇喷一次重水。一般可出5潮菇，产量20kg/m2。
（二） 平菇的栽培
1．常用栽培原料
香菇袋栽
（1）主料：棉籽壳、玉米芯、豆秸等；
2．辅料：麦麸、玉米面、米糠等；
3．化肥：尿素、过磷酸钙、石膏等；
4．农药：生石灰、多菌灵等。
2．生料
1．配方举例：棉籽壳97%，石灰2%，三元复合肥1%，料水比1：1.3；
2．堆积方法：按配方将料拌匀后，堆积2小时后，喷洒0.1%多菌灵，即可装袋；
3．要求：料必须新鲜，不结块、不霉变；气温在15℃以下。
3．发酵料
1．配方举例：棉籽壳88%、麦麸10%、石灰2%，料水比1:1.3。
2．发酵方法：按配方将料拌匀后，堆积成高1米、宽1米左右的长堆，两天后开始翻堆，以后每天翻堆一次，共发酵6天左右，料内长满放线菌。
3．要求：料不必新鲜，高温、低温季节均可。
4．栽培方法
1．袋栽；
2．床栽；
3．出菇管理：35天后可采头潮菇，清除菇脚和死菇，补水。15天后，又出一潮菇。
（三）香菇的栽培
1．常用栽培原料
1．主料：阔叶木屑、棉籽壳等；
2．辅料：麦麸、玉米面、米糠等。
2．栽培袋的制作
1．配方举例：木屑78%，麦麸20%，石膏1%，糖1%；
2．拌料、装袋：料要过筛，袋规格：17×33聚丙烯塑料袋、17×55聚丙烯塑料袋。
3． 灭菌
按常规方法121℃灭菌2h。
4．接种与培养
打孔接种，扎孔通气培养。
5．栽培方法
1．袋栽；
2．菌棒试栽培；
3．块栽。
6．出菇管理
转色、采菇、注水、二潮菇。
（四）金针菇
1．原料
（1）配方：与香菇相似，但麦麸的含量为25%-30%，比香菇高5%-10%；
2．处理方法：熟料法。
2．栽培方法
1．袋栽：17×33聚丙烯塑料袋，装半袋料；17×55聚丙烯塑料袋，两头接种。
2．瓶栽：750、800、1000mL瓶，瓶口直径7厘米，瓶口套一硬质塑料套，出菇用。
鸡腿菇覆土栽培
（五）鸡腿菇
1．原料
1．配方：主料为棉籽壳、麦草、稻草等；
2．处理方法：发酵法。
2．栽培方法
与平菇袋栽法相似。
（六）木耳
1．原料
1．配方：主料为木屑、棉籽壳等，辅料为麦麸米糠等，配比与香菇相似；
2．处理方法：熟料法。
2．栽培方法
熟料法，袋栽，17×33聚丙烯塑料袋，两头接种，菌丝长满后。在袋上开三角形口，子实体从口中长出。可采用挂袋法或床架式栽培法，
（七）其它食用菌的栽培
1．灵芝：原料与香菇相似，菌丝满袋后，采用地栽法。
2．猴头：原料与香菇相似，采用袋栽（套颈圈）或瓶栽法。
3．巴西蘑菇：原料及栽培方法与双孢蘑菇相似。
