病害防治胡子鲶病害较少，主要分布有： 车轮虫病：由车轮虫寄生引起，鱼种阶段可用每方水用0.5克硫酸铜和0.2克硫酸亚铁合剂全池泼洒防治，或用“鱼康”A型杀虫剂、“鱼虫净”按量稀释全池泼洒。 三代虫病：由三代虫感染引起。防治可用25ppm的高锰酸钾溶液浸洗病鱼15～30分钟，也可参照车轮虫治疗方法。 水霉病：由水霉菌感染引起。用生石灰清塘，减少日常操作受伤，密度合适，规格一致是有效防止该病产生的原因，发病后可用30%～40%的食盐水浸洗病鱼5～30分钟治疗。 肠炎病：由细菌感染引起。投饵定时定量，保证饵料质量，饲料品种更换要渐变，能有效预防该病发生。发病后可用“鱼菌清”、“鱼必康”、“鱼菌灵”等抗菌药予以治疗或拌饵投喂。 小瓜虫病：寄生在鱼的皮肤和鳃的表皮,吸收营养,引起组织增生,形成脓泡,并产生大量粘液,感染严重时.皮肤和鳃上的脓泡会变成许多小白点。发现此病时,可用0.1ppm硝酸亚汞全池泼洒,重复一次,便能有效地杀灭。 尾孢子虫：主要寄生在鱼皮肤,其次是鳃、尾、鳍上,亦有少数胞囊,随着病情发展胞囊增大,数量增多,如不及时治疗.会使大部分鱼受到感染。可用15ppm甲醛溶液消毒。