蚯蚓在箱养和大型养殖床中的蚓粪与卵茧需要分离，分离方法有以下几种。

1，框漏法

对经过几次加料，成蚓密度大，卵茧数量多，饲料已基本粪化的养殖床，把蚯蚓和粪粒一起装入底部有1．2厘米X1．2厘米的铁丝网的大木框，利用蚯蚓避光的特性，在光照下，蚯蚓会自动钻到下层，然后用刮板逐层把粪粒和卵茧一起刮人料斗车，直至蚯蚓通过网眼、钻人下面新饲料为止。然后，把粪粒和卵茧移人孵化床，在适宜温、湿度条件下，经30—40天，卵茧全部孵化，并长成幼蚓后，再继续采用上述框漏法，把幼蚓与粪粒分离，幼蚓进入新养殖床粪粒经风干、筛选、化验和包装成为有机复合肥料供应市场或白用。

2．饵诱法

当养殖床基本粪化后，采取以下方法：

(1)停止在表面加料而在养殖床两侧添加新饲料；

(2)将成蚓诱人新饲料中，待绝大部分诱出以后，再将含有大量蚓茧的老饲料床全部清出，然后再把老床两侧的新饲料和蚯蚓合并，清出的蚓茧和蚓粪，移在放有新饲料的养殖床表面进行孵化；

(3)待幼蚓孵出后，进入下层新饲料层采食，然后把上层的蚓粪用刮板刮出，进行风干，过筛包装作有机肥料。

3．刮粪法

利用光照，使蚯蚓钻人下方，然后用刮板将蚓粪一层一层刮下，刮到最后蚯蚓集中在养殖床地面。取出的蚓粪和卵茧移人孵化床进行孵化培养。幼蚓孵出后，用同法再进行分离。