1、选择优良品种和种藕。深水藕应选择适宜深水栽培的优良品种。如台莲藕等。选择具有本品种优良特征，后把节较粗的整藕或较大的子藕作种藕。种藕必须新鲜、粗壮、完整无缺，至少有4节以上充分成熟的藕身，顶芽完整。

2、选择适宜的水面。深水藕应选择浅湖、河湾、水流平缓、涨落平稳，水下淤泥层厚达20厘米以上的水面。夏季汛期最大水位不超过120厘米。

3、适当整地，合理施基肥。深水藕栽植前如条件允许，应带水耕耙。如果水位较深，不便耕耙，可用大铲将田土适当整平。每亩施堆厩肥1500-2000公斤或绿肥鲜草2500公斤作基肥，基肥应耕耙入土。深水田易缺磷，最好每亩施过磷酸钙20-30公斤，促进壮苗早发。

4、适时栽植。因水位较深，土壤温度回升缓慢，种植期要比浅水藕推迟10-15天。

5、固体追肥。深水中肥料易流失，不宜施液体肥料。追肥时应将厩肥或青草埋入泥中，如用化肥作追肥，应将化肥与河泥充分混合，做成泥团，施入藕田。

6、防涝防风浪。深水藕水位不易调节。在汛期到来时，如果立叶被淹没，应在24小时内紧急排水，使荷叶露出水面，以防淹死。深水藕易受风浪影响，特别是结藕期受台风袭击，常造成严重减产。因此，可在藕田四周种几行茭白，可防风浪和风害。

7、适时采收。深水藕多为晚熟品种，不采收嫩藕，在立叶全部发黄时，即可挖藕上市。收获嫩藕时，首先要确定藕的生长位置与方向。藕的方位在后把叶和终止叶直线的前方。后把叶是终止叶前面的一片叶子，也是下降阶梯的最大、最后的一片叶子。终止叶俗称“花吊”，终止叶的特点是叶片卷而不开展，叶背微红色，叶柄刺少，叶中心长叶柄处的叶蒂头特别红。有时因地下莲鞭纵横交错，找不到哪是后把叶和终止叶连成直线时，可把这两片荷叶摘除，把一根叶柄浸入水中，用嘴对另一根叶柄通气孔吹气，如果浸入水中的叶柄有气泡冒出来，说明这两片叶是相通的，生长在同一根地下茎上，它们的下面就是藕的位置。

嫩藕的收获。一般都在水中进行，收获时用手扒泥，将藕身附近的泥扒开，然后沿着后把叶的叶片向下，折断莲鞭，慢慢将整藕向后拖出。深水荡藕，不能用手挖藕，可用脚探到藕的位置，同时用手持着后把叶的叶柄，用脚挖去藕旁之泥，用藕钩钩住藕节，慢慢将其拉出水面。嫩藕质脆，容易折断，收获时要特别小心。有的地方收获嫩藕时，只挖主藕，留下子藕，到翌年4月上旬前收老藕。有的留下子藕作翌年的种藕。嫩藕采收前一天或数天，将荷叶在叶蒂处摘去，只留后把叶和终止叶，以作采收时的标记。这时叶片青绿，晒干后可做包装材料，1000平方米可采收干荷叶80～90千克。这时摘去叶片，对地下茎发育没有多大影响，使地下部分停止呼吸，促使藕身上附着的锈斑还原，提高莲藕的质量。

嫩藕的产量，因栽培地区、条件、品种不同，相差较大。一般每公顷产15～20吨。早熟品种及早收获的产量较低，晚熟品种和晚收获的产量较高。同时，田藕的产量往往比荡藕的产量要高一些。通常来说，栽植后的第一、第二年的产量较低，第三、第四年产量最高，到第五、第六年，产量趋于下降，这时要及时轮作换茬。

莲子成熟时，莲蓬呈青褐色，莲房孔开始张开，莲子果皮呈茶褐色。伏子因烈日暴晒，莲蓬易发黑，应在变黑色时才可收获，秋子只要稍带黑色就可收获。收获莲子必须及时，过嫩莲子不充实，晒后干瘪，过老风吹容易脱落。