针对预防兔传染病的疫（菌）苗，制定合理的初次免疫日龄、免疫间隔时间，称为免疫程序。 常用的疫（菌）苗免疫程序如下：
1、兔瘟组织灭活疫苗（兔病毒性出血症疫苗）：预防兔病毒性出血症（俗称兔瘟）。30～35日龄兔初次免疫，每隔半年免疫1次。
2、兔巴氏杆菌灭活菌苗：预防兔巴氏杆菌病。40～45日龄兔初次免疫，每隔半年免疫1次。
3、兔魏氏梭菌氢氧化铝菌苗（或称兔魏氏梭菌性肠炎灭活菌苗）：预防兔魏氏梭菌病。35～40日龄兔初次免疫，每隔半年免疫1次。
4、支气管败血波氏杆菌灭活菌苗：预防兔支气管败血波氏杆菌病。怀孕兔产前2～3周免疫1次。25～30日龄仔兔初次免疫，每隔半年免疫1次。
5、兔巴氏杆菌兔支气管败血波氏杆菌灭活二联菌苗：预防兔巴氏杆菌、支气管败血波氏杆菌引起的呼吸道疾病。怀孕兔妊娠1周后免疫1次。25～30日龄仔兔，间隔半年免疫1次。
6、兔瘟兔巴氏杆菌二联苗：预防兔病毒性出血症（兔瘟）、兔巴氏杆菌病，35～40日龄兔初次免疫，每隔半年免疫1次。或者按照疫苗的使用说明书进行。
7、兔瘟兔巴氏杆菌兔魏氏梭菌三联苗：预防兔病毒性出血症（兔瘟）、兔巴氏杆菌病、兔魏氏梭菌病。35～40日龄兔初次免疫，每隔半年免疫1次。或者按照疫苗的使用说明书进行。
也可结合本地特点自制或购买其他疫苗。
二、使用兔用疫（菌）苗应注意事项
1、购买的疫（菌）苗必须是国家定点或指定的生物制品厂或相应的销售机构，清楚地标明疫（菌）苗的名称、生产日期、生产批号、保存及使用方法、生产厂家并且附有合格证。
2、疫（菌）苗应妥善保存。一般应在18℃以下、4℃以上避光保存。没有冰箱时可贮存于地窖水井水面上部。切勿高温和冰冻保存（如疫苗注明可冰冻保存的除外）。保存时间一般在6个月以内。
3、疫（菌）苗使用前要认真检查，凡有下列情况之一者不应使用：无标签或标签不清，又不确知的疫（菌）苗，过期失效的疫（菌）苗；质量有问题的疫（菌）苗（如发霉、色变、沉淀结絮、有异物等）；瓶壁破裂或瓶塞脱落、瓶壁渗漏的疫（菌）苗；未按要求保存的疫（菌）苗等。
4、所有注射器和针头等应严格消毒，每只兔使用一支针头。
5、疫（菌）苗使用前必须摇匀，一瓶疫（菌）苗应一次用完。若没有用完而又准备在短期内使用，应抽出瓶内空气，针孔处应该用石蜡密封。
6、注射部位应先消毒，注射剂量要准确，注射完毕拔出针头时，要用棉球闭塞针孔并轻轻挤压，以防疫苗从针孔处外流。
7、疫（菌）苗注射后应立即做好记录。
8、如果使用的是合格疫苗，如使用了二联或三联苗进行了免疫接种，一般不必再注射单联疫苗了，除非确信此次免疫失败。
