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1、水霉病：病鳅可用3%的食盐溶液或者聚维酮碘等浸洗5～10分钟。

2、打印病：病灶一般呈椭圆形，圆形，浮肿有红斑。患处主要在尾柄基部。流行于7～8月份。可用1g/m3的漂白粉或2～4g/m3的五倍子进行全池泼洒。

3、赤鳍病：此病对泥鳅危害大、发病率高，由杆菌引起。先是鱼鳍或体表部分表皮剥落，呈灰白色，肌肉开始腐烂，肛门部位发红，继而在这些部位出现血斑，并逐渐变为深红色，严重时出现鳍条脱落，不摄食，直至死亡。主要流行于夏季。应避免鱼体受伤，苗种放养前应用3%的食盐水浴洗消毒。

4、舌杯虫病：寄生于泥鳅的皮肤或鳃上，平时摄取四周水中的食物作营养，对泥鳅没有多大影响。但若大量寄生在鳅苗上，会造成呼吸困难，严重时导致鳅苗死亡。一年四季都可发病，以5～8月份较为普遍。预防主要是在鳅种放养前用8g/m3水硫酸铜溶液浸洗15～20分钟，发病后治疗则用0.7g/m3水硫酸铜和硫酸亚铁(5:2)合剂全池泼洒。

5、车轮虫病：寄生于鳃部和体表。患病后摄食量减少，离群独游，严重时虫体密布，如不及时治疗，会引起死亡，流行于5～8月份。预防措施是用生石灰清塘;防治方法为按池水每立方米用晶体敌百虫0.7g全池泼洒。