随着“健康中国”战略的实施推进,医疗大数据的相关研究已经成为医疗领域的工作基础和热点,海量的数据已经成为这个时代的重要符号。大数据时代的到来,临床数据形式多样,对于临床工作者来说是机遇更是挑战。在临床诊治的过程中,对临床数据的收集、整理和利用,将其转变成科研资源,与分子层面的组学数据相结合,可以协助我们更好的寻找临床科研问题与科研证据,为自身科研工作提供帮助,并获取高质量的科研成果。
面对越来越重的科研压力,以及越来越高的SCI文章要求,如何才能在临床实践中捕捉科研方向,进行科研设计,完善职业规划,都是我们面对的迫切且实际的问题。
为进一步提升临床工作者的科研素养,加强数据挖掘、分析、应用的能力,提高临床科研项目的质量和水平,撰写并发表高质量的SCI论文。中国协和医科大学出版社将于2019年7月24-26日举办“临床研究数据分析与优质SCI论文写作发表培训班”【项目编号:2019-12-07-239(国)】特邀中国医学科学院北京协和医学院、军事医学科学院等统计与信息学专家讲解如何对临床数据统计分析、生物医学大数据挖掘及生物信息学分析等去设计和开展研究,特邀国际顶级期刊《The Lancet》、《CELL》,国内核心期刊《中国肺癌杂志》等编审及审稿人讲解SCI论文的撰写及投稿技巧。
一、时间地点
时 间:2019年7月24-26日
地 点:北京京瑞大厦(北京市朝阳区东三环南路17号)
二、培训对象
对临床研究数据分析的具体方法及 SCI 论文写作等有学习需求的科研人员、临床医师、企事业单位管理人员、技术研发人员、博(硕)士研究生等;
三、培训内容
模块一 临床大数据相关知识介绍
1、 临床大数据概述
2、 临床大数据的收集、整合和管理
3、 临床大数据的样本库和资料库的建立
模块二 疾病组学大数据相关知识介绍
1、 疾病相关的组学大数据概述
2、 基于二代测序技术的多组学数据获取
3、 疾病组学数据库、知识库和工具库
模块三 疾病大数据挖掘思路
1、 案例形式介绍临床大数据的数据挖掘思路
2、 案例形式介绍组学大数据的数据挖掘思路
模块四 R软件实操
1、 R软件的下载和安装
2、 R软件的基本运算(向量运算、矩阵计算、基本统计计算)
3、 R软件的基本统计分析操作(t检验,卡方检验,线性回归,logistic回归)
4、 统计分析批处理的R软件实现
模块五 数据挖掘方法——分类与聚类
1、 分类的概念及分类的性能与评估
2、 决策树与随机森林分类器的构建及R软件实现
3、 决策树与随机森林结果的可视化
4、 主成分分析及应用主成分分析绘制分类图
5、 聚类的概念及常用聚类方法(K均值聚类与系统聚类)
6、 K均值聚类与系统聚类的R软件实现
7、 K均值聚类与系统聚类的可视化
8、 双向聚类热图的绘制
9、 基于数据挖掘中的分类与聚类发表 SCI 论文的经验分享
模块六 数据挖掘方法——关联规则与贝叶斯网络
1、 关联规则的概念及常用关联规则分析方法(Apriori算法)
2、 关联规则分析的R软件实现
3、 关联规则的可视化
4、 贝叶斯网络的概念及构建
5、 基因与环境互作的贝叶斯网络构建及R软件实现
6、 基于数据挖掘中的关联规则与贝叶斯网络发表 SCI 论文的经验分享
模块七 系统综述与Meta分析
1、 系统综述与Meta分析概述
2、 选题思路和方案设计
3、 文献检索与资料收集
4、 Meta分析方法解析
模块八 SCI论文写作与投稿
1、 论文写作与投稿概述
2、 Introduction和Experiment的写法
3、 如何撰写Results和Discussion
4、 如何撰写Title,Abstract,Reference,Cover letter
5、 论文写作中常见的语法问题
6、 如何提高论文中的英文水平
7、 如何选择合适的期刊
8、 如何答复审稿者意见、说服审稿人
四、部分授课专家
刘 谦《中国肺癌杂志》,《Thoracic Cancer》,《Asia-Pacific Journal Of Clinical Oncology》编辑部主任
个人简介:刘谦,男,毕业于山东医科大学,《中国肺癌杂志》(Medline,CSCD,北大核心,统计源核心),《Thoracic Cancer》(SCI-E收录),《Asia-Pacific Journal Of Clinical Oncology》(SCI-E收录)三本期刊编辑部主任
社会任职:
1. 中国科技期刊编辑学会青委会 委员
2. 中国科技期刊协会 会员
3.中国高校科技期刊编辑协会英文刊专业委员会 秘书长
4.中国高校科技期刊协会数字出版专业委员会 副主任委员
5. 中国抗癌协会医学期刊专委会 常务委员
6. 中国高校科技期刊协会国际化出版专委会 副主任委员
7.中国高校科技期刊协会医学专业委员会委员
8.天津市期刊协会理事
9.天津市高校科技期刊协会理事
获奖:
1.荣获中国科技期刊协会青年编辑“骏马奖“
2.荣获《Endoscopic Ultrasound》(SCI-E收录)杰出贡献奖
3.荣获《中国药理学报》(SCI收录)杰出贡献奖
4. 荣获中国抗癌协会优秀期刊编辑奖
专业特长:
2004年起在中国科学院《中国药理学报》(SCI)编辑部任编辑,自2008年起任《中国肺癌杂志》编辑部主任,2010年创办《Thoracic Cancer》并任主任, 2016年起任《Asia-Pacific Journal Of Clinical Oncology》编辑部主任。刘谦主任具有丰富中英文科技期刊办刊经验,熟悉国内外生物医学出版社及期刊稿件处理流程及投稿系统,对科技期刊评价也有一定造诣,曾发表SCI收录学术论文十余篇,国内外编辑出版类核心期刊发表文章近20篇。
刘 冰 中华医学会杂志社副社长
个人简介:刘冰,编审。中华医学会杂志社副社长,负责143种中华医学会系列杂志出版、经营、数字化等有关管理工作。兼任《Bio-X Research》编辑部主任。《编辑学报》编委,中国科技期刊编辑学会医学期刊工作委员会秘书长,中国科技期刊编辑学会青年工作委员会副主任。曾长期在《中华心血管病杂志》工作并担任编辑部主任。
参与多项国家及省市级课题研究-《中国科技期刊发展战略研究》《中国科协出版相关费用调查研究》《我国科技期刊的数字化出版平台建设》《北京市科委临床研究顶层设计在项目管理中的应用》。关注并研究符合临床研究规律的临床研究项目评审体系的优化和规范化问题。在医学伦理学、科研评价、数字出版等方面有较为深入的研究,发表相关学术论文数十篇。
舒文杰 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所副研究员
个人简介:舒文杰,2007年获国防科技大学控制理论专业工学博士学位,博士论文获2010年湖南省优秀博士论文,及2010年全国百优博士学位论文提名论文。现为军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所副研究员,生物信息学课题组PI。主要从事生物信息学与计算生物学研究。
作为负责人承担国家863、自然基金,及军队科研项目十余项。以共同通讯作者/第一作者,在Nature genetics、NAR、Bioinformatics等专业期刊共发表SCI论文三十余篇,获得授权发明专利3项,软件著作权三十余项,发表个人专著1本。近年来,基于多组学生物大数据,在计算生物学、表观基因组学,胚胎发育等领域开展了相关研究。同时,在国内较早将深度学习应用在生物信息学领域,提出了基于深度学习的一系列新方法。
代表性文章:
1. Han L?, Ren C?, Jun Zhang, Shu W* & Wang Q* (2019.1) Differential roles of Stella in the modulation of DNA methylation during oocyte and zygotic development. Cell Discovery, 5, Article number: 9. (SCI, IF2017 4. 462) (co-corresponding author)
2. Han L?, Ren C?, Li L?, Li X, Ge J, Wang H, Miao Y, Guo X, Kelle H. Moley, Shu W* & Wang Q* (2018.2) Embryonic defects induced by maternal obesity in mice derive from Stella insufficiency in oocytes. Nature Genetics, 50, 432–442. (SCI, IF2017 27. 959) (co-corresponding author)
3. Ouyang Z, Liu F, Zhao C, Ren C, An G, Chuan M, Bo X*, Shu W* (2018.3) Accurate identification of RNA editing sites from primitive sequence with deep neural networks. Scientific Reports 8: 6005. (SCI, IF2017 4.259) (co-corresponding author)
4. Yang B?, Liu F?, Ren C, Ouyang Z, Bo X, Shu W* (2017.07) BiRen: predicting enhancers with a deep-learning-based model using the DNA sequence alone. Bioinformatics, 33(13):1930-1936. (SCI, IF2017 7.307) (co-corresponding author)
5. Liu F, Ren C, Li H, Bo X, Shu W* (2016.07) PEDLA: predicting enhancers with a deep learning-based algorithmic framework. Scientific Reports 6: 28517. (SCI, IF2017 4.259; IF2016 5.228) (co-corresponding author)
6. Liu F, Ren C, Li H, Zhou P, Bo X, Shu W* (2016.03) De novo Identification of replication-timing domains in the human genome by deep learning. Bioinformatics, 32(5), 2016, 641–649. (SCI, IF2017 7.307; IF2016 5.766) (co-corresponding author)
7. Wenjie Shu, Hebing Chen, Xiaochen Bo, Shengqi Wang. (2011.06) Genome-wide analysis of the relationships between DNaseI HS, histone modifications, and gene expression reveals distinct modes of chromatin domains. Nucleic Acids Research. 2011, 39(17):7428-7443. (SCI, IF2012 8.278; IF2011 8.026) (first author)
五、学分授予
培训考核合格者授予国家I类继续医学教育学分。
六、联系我们
联系人:杨帆、黄浩
电 话:010-62862451、13269467722
邮 箱:13269467722@163.com
地 址:北京市东城区东单三条9号 中国协和医科大学出版社206室